Program Studi Pendidikan Agama Islam memiliki visi, misi dan tujuan sebagai berikut:
Visi
Menjadi program studi Pendidikan Agama Islam yang Unggul, terkemuka dan profesional di Provinsi Jambi wilayah Barat tahun 2022
Unggul mengandung makna bahwa Prodi Pendidikan Agama Islam STAI SMQ Bangko tidak lagi sebatas merawat dan mengembangkan tradisi studi keislaman, tetapi menstimulasi lahirnya inovasi dan kreativitas dalam pengembangan studi pendidikan agama Islam.
Terkemuka mengandung makna bahwa Prodi PAI STAI SMQ Bangko diharapkan tampil menjadi pelopor dibandingkan prodi PAI lainnya dalam pengembangan studi pendidikan agama Islam.
Profesional mengandung makna bahwa Prodi PAI STAI SMQ Bangko diharapkan menjadi produsen sarjana pendidikan agama Islam yang terampil dalam mengaplikasikan pengetahuan yang diperolehnya
Misi
Menyelenggarakan pendidikan dan pengajaran dalam rangka mewujudkan tenaga pendidik profesional di Madrasah, Pesantren dan Sekolah
Mengembangkan penelitian kependidikan dalam rangka usaha perbaikan proses pendidikan, khususnya di Madrasah, Pesantren dan Sekolah
Menyelenggarakan pengabdian kepada masyarakat dalam rangka memperkuat keberadaan lembaga Program Studi Pendidikan Agama Islam
Meningkatkan kerja sama dengan berbagai pihak dalam rangka meningkatkan pelaksanaan tridarma perguruan tinggi Program Studi Pendidikan Agama Islam
Tujuan
Menghasilkan Sarjana Pendidikan Islam sebagai pendidik profesional yang terampil, responsif, inovatif, mandiri dan berakhlak mulia
Menghasilkan lulusan yang memiliki keterampilan dalam pengelolaan Madrasah, Pesantren dan Sekolah
Menghasilkan lulusan yang memiliki rasa tanggungjawab terhadap kinerja dan profesi keguruan
Menghasilkan lulusan yang mampu melakukan penelitian tepat guna dan berdaya guna bagi pengembangan pendidikan di Madrasah, Pesantren dan Sekolah
Menghasilkan lulusan yang mampu mengaflikasikan ilmu-ilmu keagamaan dalam kehidupan sehari-hari pada masyarakat.